软件著作权登记首先要登录中国版权保护中心网站，注册账号及设置密码（已有账号和密码则无需再次注册），然后再按照要求进行逐项填报，具体的办理流程如下：
1、办理流程
填写申请表→提交申请文件→登记机构受理申请→审查→取得登记证书
注释：如已登记软件的著作权发生继受（受让、承受或继承），权利继受方办理著作权登记时需先做软件著作权登记概况查询。
2、填写申请表
在中国版权保护中心网站上，首先进行用户注册，然后用户登陆，在线按要求填写申请表后，确认、提交并在线打印。
3、提交申请文件
申请人或代理人按照要求提交纸质登记申请文件。
4、登记机构受理申请
申请文件符合受理要求的，登记机构在规定的期限内予以受理，并向申请人或代理人发出受理通知书；不符合受理要求的，发放补正通知书。根据计算机软件登记办法规定，申请文件存在缺陷的，申请人或代理人应根据补正通知书要求，在 30个工作日内提交补正材料，逾期未补正的，视为撤回申请；符合《计算机软件著作权登记办法》第二十一条有关规定的，登记机构将不予登记并书面通知申请人或代理人。
5、审查
经审查符合《计算机软件保护条例》和《计算机软件著作权登记办法》规定的，予以登记；不符合规定的，发放补正通知书。根据《计算机软件登记办法》规定，申请文件存在缺陷的，申请人或代理人应根据补正通知书要求，在 30个工作日内提交补正材料，逾期未补正的，视为撤回申请；符合《计算机软件著作权登记办法》第二十一条有关规定的，登记机构将不予登记并书面通知申请人或代理人。
7、获得登记证书
申请受理之日起30个工作日后，申请人或代理人可登录中国版权保护中心网站，查阅软件著作权登记公告。
北京地区的申请人或代理人在查阅到所申请软件的登记公告后，可持受理通知书原件在该软件登记公告发布3个工作日后，到中国版权保护中心版权登记大厅领取证书。
申请人或代理人的联系地址不在北京的，中国版权保护中心将按照申请表中所填写的地址邮寄证书，请务必在申请表中填写正确的联系地址。
补充说明：申请受理之日起30个工作日
- 这里所说的“申请受理之日起30个工作日”并不是按照首次提交著作权登记开始算的，确切来讲是按照按照“窗口”受理人员审核通过之日开始算。
- 如果申请人首次提交被退回了，这个过程就是“补正”过程，在“补正”后“窗口”受理人员审核通过之日才是本文所说的“申请受理之日”。
- 本文所说的30个工作日是不包含周六日和法定节假日的。
